La planta académica del CIDE está altamente calificada: cuenta con alrededor de 67 investigadores; de ellos, 90% tiene doctorado en las mejores universidades del mundo, y más de 77% es miembro del Sistema Nacional de Investigadores. Todos ellos participan en los programas docentes y desarrollan proyectos de investigación de frontera en sus respectivas disciplinas. Además, el Centro se enriquece de forma permanente con un programa de profesores invitados provenientes principalmente de universidades de Estados Unidos y Canadá.