Héctor Núñez es Doctor en Economía Agrícola y Aplicada por la Universidad de Illinois en Urbana-Champaign. Su investigación se centra en el análisis empírico de los mercados energéticos, agrícolas y ambientales, con énfasis en temas de transición energética, eficiencia productiva y desarrollo regional. 

A lo largo de su trayectoria, ha sido investigador visitante en la Universidad del Rosario y en la Universidad de California, Davis (becario Fulbright-García Robles), así como investigador en la Dirección General de Investigación Económica del Banco de México. Es miembro Nivel II del Sistema Nacional de Investigadoras e Investigadores y ha desempeñado labores editoriales y de coordinación académica en el CIDE. 

La sede del CIDE Región Centro, ubicada en la ciudad de Aguascalientes, fue inaugurada el 14 de septiembre de 2011. Actualmente alberga a la División de Economía Aplicada y ofrece dos programas académicos: la Licenciatura en Políticas Públicas y la Maestría en Métodos para el Análisis de Políticas Públicas.